创新是实现经济提质增效的重要推动力。市南区注重突出企业技术创新主体地位，加快建设创新创业载体，努力提升科技创新能力，为适应和引领经济发展新常态提供有力支撑。
日前，由青岛海大生物集团自主研发的浒苔多糖农业添加剂成功上市。这款产品以浒苔为原料，添加到各类农业肥料中，可使化肥使用量降低两到三成。产品能够在短短两年时间内上市，离不开市南区科技资金的大力扶持。
目前，海大生物企业技术中心已发展成为国家级绿藻研究及应用技术中心，相关产品荣获国家海洋工程科技奖一等奖。
十二五期间，市南区累计投入科技发展资金3.6亿元，用于基础前沿、战略性高新技术、重大共性关键技术研发等科技创新领域。目前，全区已建起63个市级以上重点实验室，32个工程技术研究中心和28个企业研发中心。
为提升企业科技创新能力，市南区成立科技创新委员会，先后制定知识产权奖励资金管理办法等7项促进科技成果转化的政策措施。在新三板挂牌的青岛科恩瑞通是国内无线通信行业的领军企业，其产品已在林业、海事等领域广泛应用。企业在发展过程中，获得市南区30万元的知识产权奖励资金。
市南区不断加快创新创业载体建设，2015年，在软件动漫、海洋科技、文化创意、高端服务等领域，新建科技企业孵化器3个，区域创新型孵化器及众创空间14个，面积达到33万平方米，集聚创客1.1万多人。
2016年，市南区把创新创业创客工作纳入为民办实事项目，区财政预算支出7700万元，力争年内创客空间达到20家。同时，支持企业与科研院所、高校协同创新，新增市级技术创新平台3个，不断提升企业创新能力，加快创新型城区建设。
